Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC5Q00444 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms