Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX3P78415 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX3P78415 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX3P78415 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms