Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT85P78386 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms