Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO1P63165 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMO1P63165 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms