Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-16P61578 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-16P61578 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms