Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms