Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms