Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms