Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA9P57773 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA9P57773 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA9P57773 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms