Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME5P56597 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NME5P56597 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME5P56597 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME5P56597 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NME5P56597 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NME5P56597 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NME5P56597 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NME5P56597 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms