Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL23P55773 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL23P55773 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL23P55773 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL23P55773 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms