Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFAP4P55083 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms