Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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PGGT1BP53609 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP53609 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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