Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A2P52657 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms