Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSR4P51571 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSR4P51571 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SSR4P51571 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSR4P51571 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSR4P51571 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms