Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms