Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5CP51148 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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