Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK7P50613 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK7P50613 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK7P50613 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms