Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms