Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCCP43146 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCCP43146 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCCP43146 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCCP43146 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCCP43146 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCCP43146 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
DCCP43146 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms