Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELK3P41970 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELK3P41970 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELK3P41970 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ELK3P41970 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELK3P41970 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELK3P41970 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms