Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTPDP35247 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms