Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NF2P35240 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NF2P35240 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NF2P35240 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NF2P35240 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NF2P35240 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NF2P35240 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NF2P35240 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NF2P35240 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms