Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJA4P35212 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJA4P35212 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms