Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC9P31274 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC9P31274 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms