Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRPAP1P30533 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms