Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP1P29466 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms