Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARK3P27448 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK3P27448 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK3P27448 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK3P27448 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK3P27448 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms