Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms