Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms