Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP4AP20648 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms