Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL3P19876 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL3P19876 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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