Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A1P19634 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms