Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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