Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMPD1P17405 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms