Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREB1P16220 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms