Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GP1BBP13224 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms