Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI4P10075 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GLI4P10075 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI4P10075 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms