Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms