Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIT1P09914 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT1P09914 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms