Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB5P09067 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms