Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP3P08254 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP3P08254 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP3P08254 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms