Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFMP07197 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFMP07197 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFMP07197 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFMP07197 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFMP07197 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEFMP07197 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEFMP07197 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEFMP07197 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEFMP07197 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEFMP07197 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms