Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms