Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH1O95406 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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