Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
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RAPGEF3O95398 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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RAPGEF3O95398 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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RAPGEF3O95398 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RAPGEF3O95398 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAPGEF3O95398 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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