Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9AO75110 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms