Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMFO60524 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMFO60524 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMFO60524 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMFO60524 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMFO60524 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms