Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORBS3O60504 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms