Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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